La educación en el cantón Francisco de Orellana se imparte en dos modalidades; la educación intercultural bilingüe e hispana. El sistema educativo es fiscal y fisco misional de categoría mixta.

En la parroquia San José de Guayusa existen 13 establecimientos escolares cuya modalidad presencial permite una enseñanza más directa maestro-estudiante y 3 Colegios modalidad a distancia con asistencia de solo tres días a la semana en unos casos y otros solo los fines de semana; modalidades que permiten que el estudiante trabaje y pueda contribuir con recursos económicos para su familia.

CENTROS EDUCATIVOS EN LA PARROQUIA SAN JOSÉ DE GUAYUSA

ESCUELA YAGUACHI.-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte sureste de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad Las Minas

ESCUELA RIO PAYAMINO.-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte sureste de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad Las Cayanas

ESCUELA PERLA DEL ORIENTE.-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte sur de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad San Miguel de Guayusa

CENTRO DE EDUCACIÓN BILINGÜE WAYUSA (CECIBEB).-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte central de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad San José de Guayusa

UNIDAD EDUCATIVA A DISTANCIA YANCHANA INTI EXTENSION GUAYUSA.-Este Colegio está ubicada a setecientos metros del Centro poblado Parroquial y funciona dentro del área escolar del Centro de Educación Básica “Wayusa” ya descrito anteriormente.

ESCUELA ENRIQUE MAMALLACTA.- Esta escuela se encuentra ubicada en la parte norte de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad Rumipamba

ESCUELA WAYRA PAMBA (CECIB).- Esta escuela se encuentra ubicada en la parte noroccidental de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad Atacapi

UNIDAD EDUCATIVA A DISTANCIA YANCHANA INTI EXTENSIÓN ATACAPI.- Este Colegio a distancia funciona dentro del área escolar del Centro Educativo Wayra Pamba ya descrito anteriormente.

ESCUELA MUNDITI URKU (CECIB).-ESTA escuela se encuentra ubicada en la parte noroccidental de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad Asociación Centro Quichua Lumucha

ESCUELA JOSÉ YUMBO SAMUNA (CECIB).-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte noroccidental de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad Lumucha

CUNNIDAD EDUCATIVA A DISTANCIA YANCHANA INTI EXTENSIÓN LUMUCHA.-La Comunidad cuenta con un Colegio a distancia con el nombre de Extensión Lumucha, colegio unidocente pero que brinda los seis años de colegiatura.

ESCUELA 27 DE FEBRERO (CECIB).-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte noroccidental de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad Kanoa Yacu

ESCUELA INTI PAKARI (CECIB).-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte noroccidental de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad 10 de Agosto

ESCUELA LOS GUAYACANES.-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte noroccidental de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad Supay Yacu

ESCUELA VENANCIO GREFA.-Esta escuela se encuentra ubicada en la parte noroccidental de la Parroquia San José de Guayusa, pertenece a la Comunidad San Pedro del río Coca